En el área de pre-PCR , el software genera automáticamente una lista de trabajo basada en las muestras principales registradas y los análisis solicitados, y ayuda al usuario en la preparación manual de las PCR proporcionándole información sobre la disposición de las pipetas y los volúmenes de reactivos y muestras necesarios. Alternativamente, para un mayor grado de automatización, la estación de trabajo automatizada Pre-NAT II puede incluirse en el flujo de trabajo para la preparación automatizada de las PCR. En este caso, la información de ejecución y la disposición de la PCR se transfieren de la estación de trabajo automatizada Pre-NAT II al EUROArrayProcessor.
En el área post-PCR , el EUROArrayProcessor se encarga de la dilución de las PCR con tampón de hibridación, la transferencia de los preparados de hibridación a bandejas de reactivos y la incubación, lavado y secado de los portaobjetos de EUROArray. A continuación, pueden leerse con EUROArrayScanner. La integridad de los datos está garantizada por la transmisión digital entre LIS, la estación de trabajo automatizada Pre-NAT II, el procesador EUROArrayProcessor y el software EUROArrayScan durante todo el proceso.